Gert har tidligere været partner i Vestfyns Dyrlæger.

Her arbejdede han med henvisninger på kirurgiske opgaver hos hund og kat, 

ud over det almindelige arbejde i smådyrspraksis.

På Odense Dyrehospital er Gert Jarn Pedersen en del af den kirurgiske gruppe inden for bløddelskirurgi/onkologi samt ortopædi

Gert beskæftiger sig her med kirurgiske udredninger og operationer, herunder halthedsundersøgelser, røntgen og CT-skanninger.